8月26日，“2022全國農業高新技術成果交易活動”圓滿閉幕，在現代種業路演專場，影子基因首席科學家、華中農業大學教授李新云進行了專題分享。

可提供10K-400K任意規格的個性化芯片開發，擁有全流程國產化的液相基因芯片技術平臺，擁有自主基因組選種選配平臺HiBLUP……會上，李新云介紹了影子基因這些“黑科技”。

01?功能位點基因芯片設計、制備、檢測

“基因芯片本質上是為了獲取有育種價值的基因組信息。為了提高基因組中育種信息的挖掘效率，我們需要對芯片進行不斷優化。”李新云表示。

理想的基因芯片是芯片位點正好為所研究表型全部QTN位點的芯片，但在現實情況里，設計出這樣一款理想芯片是很難的。目前常規的分子標記位點基因芯片，每個位點攜帶的有效育種信息量很少，影子基因則綜合利用了功能基因組研究最新成果，選取直接調控基因表達、蛋白質活性的功能突變，設計了全新一代功能位點基因芯片，它每個位點攜帶的有效育種信息含量更高，能有效提高育種效率。

影子基因具備完整的基因芯片設計、制備、檢測的能力，能為客戶提供10K-400K任意規格的個性化芯片開發服務。客戶案例-天鵬香芯

“天鵬香芯”是由中國農業科學院農業基因組研究所李奎教授團隊設計，影子基因制備、測試的一款豬70K功能位點基因芯片，影子基因在進行芯片制備時，對每個位點探針進行了精心設計，采用了人工智能策略優化了探針特異性，顯著提高了探針捕獲效率。測試結果表明：“天鵬香芯”位點分型準確性和檢出率都超過了99%。

02?自主液相基因芯片技術

液相基因芯片技術是指對基因組中特定的遺傳變異進行捕獲測序、高通量分型的技術。影子基因自主研發了基于CRISPR/Cas系統的液相基因芯片技術，能夠對SNP、CNV、InDel等多種遺傳變異進行檢測，該方法捕獲效率比核酸雜交捕獲方法更高。其原理如下圖：

03 國內自主基因組育種信息平臺HIBLUP

“現在動物育種都是基于BLUP框架，在計算育種值的時候都需要依賴FSPAK算法專利（美國），而在基因組時代，FSPAK也面臨著大型基因組親緣關系矩陣求逆困難等問題，難以快速處理基因組育種大數據。”談及現有工具存在的問題，李新云教授這樣介紹道。

影子基因擁有自主的HiBLUP（天權）育種大數據計算平臺，該平臺采用全新的計算策略，徹底擺脫了對國外育種計算專利的依賴，并具有快速處理百萬級群體、千萬級標記育種大數據的能力，功能涵蓋基因組選種和基因組選配所需的全部計算。

通過算法創新、并行計算、硬件加速等策略提升計算效率，HiBLUP在計算資源遠遠低于國外同類軟件情況下，運算速度可達到同類軟件的十倍以上，目前HIBLUP科研版已被全球56個國家和地區使用。

以技術立足，以專業立身。影子基因還將鉆研基因組育種領域，努力實現更多技術的國有自主化，歡迎各位老師同學垂詢相關業務。

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CORPORATION關于影子基因

武漢影子基因科技有限公司成立于2021年，與華中農業大學戰略合作，技術實力雄厚，公司致力于基因組育種技術研發與推廣應用。

影子基因Yingzi Gene，基因組育種技術的引領者，包括功能位點基因芯片設計、制備與檢測，基因組育種大數據分析，基因組育種軟件開發、表觀遺傳研究與功能突變位點挖掘等服務。公司80%的員工擁有碩士及以上學歷，擁有T7高通量測序儀、核酸自動提取工作站、高性能計算集群等平臺和設備。

公司官網：www.yingzigene.com